Na terenie gminy Dobrcz znajdują się trzy duże zbiorniki stojących wód powierzchniowych: jezioro Borówno, jezioro Kusowo, jezioro Dobrcz. Do największych wód powierzchniowych wód płynących należą rzeki: Wisła oraz Kotomierzyca. Gospodarka rybacka prowadzona jest w sposób ekstensywny. W odłowach spotykane są leszcze, płocie, liny, szczupaki oraz w niewielkich ilościach sandacz.
Rezerwaty przyrody
- Nadwiślański Obszar Chronionego Krajobrazu,
- Zespół Parków Krajobrazowych Chełmińskiego Nadwiślańskiego,
- Rezerwat Florystyczny „Augustowo”.
Pomniki przyrody
Na terenie gminy występują liczne pomniki przyrody takie jak dęby, lipy, kasztanowce o obwodach dochodzących do 300 cm.
Pomniki przyrody nieożywionej
- głaz narzutowy o nazwie „Głaz Adama Grzymały - Siedleckiego” o obwodzie 620 cm, znajdujący się przy drodze Pyszczyn - Nekla,
- głaz narzutowy o obwodzie 560 cm znajdujący się na polu w odległości 50 m od drogi Dobrcz - Pyszczyn,
- jaskinia o nazwie „Bajka” znajdująca się przy parku dworskim na zboczu parowu na działce ewidencyjnej nr 54 obrębu Gądecz w miejscowości Gądecz.
Użytki ekologiczne
- bagno o powierzchni 0,30 ha oznaczone w ewidencji gruntów obrębu Strzelce Górne,
- pastwisko o powierzchni 0,23 ha położone w miejscowości Włóki.
Parki wiejskie
W gminie Dobrcz znajduje się 12 parków wiejskich. Dominują w nich gatunki rodzimych drzew i krzewów. Gatunki obce, na ogół gorzej znoszące klimat, obumarły bądź są w stanie bardzo dojrzałym. W niektórych parkach wprowadzono nasadzenia młode, szczególnie krzewów.